除了剑类武器，玩家还可以根据战斗风格和角色特性，选择大刀、扇类武器、特殊忍具以及远程或科技类武器进行搭配。这些武器各自拥有独特的攻击模式和效果，能显著影响战斗的流畅度和角色的强度表现。
例如斩首大刀以其独特的自我修复和吸血能力著称，非常适合需要持久作战的角色。鲛肌则更为特殊，它不仅能进行攻击，还能与使用者合体，大幅提升攻防属性，尤其适合查克拉消耗较大的忍者。这类武器通常攻击范围大，伤害可观，在副本或面对多个敌人时能发挥重要作用。
扇类与功能型武器提供了不同的战术思路。宇智波团扇擅长反弹敌人的攻击，在面对远程或法术型敌人时效果显著。而六道仙人的忍具，如芭蕉扇和红葫芦，通常需要组合使用才能触发强力的封印或特殊效果。这些武器更侧重于策略性，能为战斗带来控制和反制的手段。
传统的忍者武器和特殊道具同样不可或缺。手里剑、苦无、起爆符等是忍者的基础装备，用于远程消耗和起手。锁镰、飞雷神苦无等则结合了位移与控制。一些科技武器，如查克拉大炮或苦无发射车，则拥有惊人的范围伤害。玩家应根据副本需求或决斗场环境，为角色配备相应的副武器或投掷道具。
武器的强化与进阶是提升战力的核心。装备分为多个品质等级，需要通过刷取精英副本等途径获取材料进行强化。资源有限时，应优先强化武器和戒指等攻击属性收益高的部位。对于获取的忍具，究忍具和拥有套装效果的橙色忍具优先级最高，它们能提供大量的属性加成和特殊效果。
最终的选择需综合考虑角色适配与资源规划。物理系角色优先选择提升暴击和破防的武器，而法术系角色则应侧重查克拉增幅。部分武器与特定角色存在隐藏联动，能激活特殊奥义。玩家应避免平均分配资源，集中培养核心武器，并积极参与团本等活动来获取顶级忍具。
